园中种植水生植物达五十余种，30-50厘米浅水区包括岸线以下和栈道两侧区域，主要种植中小型品种荷花、睡莲、紫菖蒲、水葱、水烛、千屈菜、黄菖蒲、慈姑等植物，50-100厘米以上较深水位的区域主要种植大型品种荷花、芡实、睡莲、芦苇、茭白等植物。按生长方式与形态特征可分为挺水植物、浮叶植物、浮水植物和沉水植物，实现了在不同水生植物与河岸曲折高低变化较大的情况下相互衬托，并通过悉心的养护和局部调整，初夏季节各种水生植物竞相绽放，形成亲人、亲水、生态的优美效果，游客游览其中感受到不同的特色景观。其岸边配置了水杉、池杉、木芙蓉、花叶美人蕉、醉鱼草等耐水湿植物。形成丰富的岸线植物景观。沿水花园木栈道及原有河道采用规则式种植，打造“花在水中开，人在景中游”的自然景观，在为游客提供亲近自然空间的同时，起到涵养水源、净化环境的生态作用。